pyhiv

• pyhiv package
  • Subpackages
    • pyhiv.align package
      • Submodules
      • pyhiv.align.align_with_reference module
      • pyhiv.align.famsa module
      • Module contents
    • pyhiv.loading package
      • Submodules
      • pyhiv.loading.read_fastas module
      • Module contents
    • pyhiv.report package
      • Submodules
      • pyhiv.report.constants module
      • pyhiv.report.pdf_generator module
      • pyhiv.report.reporter module
      • pyhiv.report.utils module
      • pyhiv.report.visualization module
      • Module contents
    • pyhiv.split package
      • Submodules
      • pyhiv.split.split module
      • Module contents
  • Submodules
  • pyhiv.cli module
    • count_fasta_files()
    • validate_n_jobs()
  • pyhiv.config module
    • get_reference_base_dir()
    • get_reference_paths()
    • validate_reference_paths()
  • Module contents
    • PyHIV()